就在海東“奇兵”收復清海鎮的第五天。隨著迅速完成休整補充的行臺軍，緊鑼密鼓的攻勢如潮，連下淳華、大山諸郡；扶桑軍連戰連敗之下。南原京內的西路總大將橘諸良麾下，也發生了分化。
因此，在三萬七千名海東軍，即將兵臨南原京城下前；隨著積累日久的矛盾激化，再加上一些別有用心的暗中挑撥手段。城內突然就爆發了一場內亂,幾乎將南原京內十三家藩軍，都卷入火并中。
結果，身為大將軍派遣在西路的監軍重臣，九州太宰府大貳的菅原少良，筑前太守/國司藤原吉房，在混亂中遇刺身亡；所屬的“御笠團”和“遠賀團”兩支九州王軍一朝散盡,轉而暴掠城中泄憤。
作為碩果僅存的博多（港）水軍統將大江匡房,也在街頭沖突當中被人當場殺死；因此失去這些得力臂助后，作為名義上西路總帥,官拜中納言、新甸君的橘諸良，在事實上已失去對于局面掌控。
等到海東軍先發的千余長從輕騎，抵達了南原京城下之后；城內十三家扶桑藩，有三家在動亂中失去藩主或是領頭人，被其他勢力兼并就此消亡；另有五家藩主搶先一步帶兵出走，東奔大將軍府。
而連同西路總大將橘諸良在內，留下來監守的其余五家藩軍，也是不免元氣大傷或是部下殘損；因此能夠用來守衛南原京的兵馬，已然不足萬余人了。為此，他不得不下令征發和武裝了隨軍民役。
然后，又下令將城內投奔而來的偽百濟，高麗叛黨，還有彌勒教的殘余；都給驅趕上了城墻,以為協守陣前的炮灰。然而，就是他這么一個倉促草就的決定,卻導致了一系列難以意料的嚴重后果。
隨著北地討逆行臺連戰連捷,反攻三千里山河的聲勢越發浩大和人心思歸；再加上收攬流亡安置百姓的手段相對得力。那些真正鐵了心,要對抗到底的鐵桿叛黨和附逆之眾,其實已經沒有剩多少。
因此，那些僥幸在戰場上得以逃脫了殺戮的幸存者，不是紛紛散入鄉野，就此化作人畜無害的良民、順民；就是通過那些義軍、鄉兵，甚至是被收降的赤褲黨，七拐八彎的暗中聯系上了行臺方面。
所以，在武州、全州各路扶桑藩軍，相繼敗退下來之前，就已經有人先行潛入了南原京；就此潛伏下來以待時機。而行臺大軍的到來，則是給了這些眼線和探子，開始暗中活躍起來的莫大契機。
因此，在來自行臺許諾在戰后“既往不咎，解甲歸鄉”的條件下，這些本土出身的叛逆殘黨，也很快發生了動搖和分化；最終在沒有驚動任何扶桑藩軍的情況下，暗中弄死了那些鐵桿從逆“奸黨”
再加上姬澤藩的內線，所暗中提供的消息。當行臺大軍圍城營地得以建成的當日；城頭的守軍中就發生了騷變。然而就在城內各路扶桑軍，連忙前往彈壓的同時。由相馬氏監守的北門突然洞開了。
埋伏城外待機的行臺軍鋒將之一,出自北地邊鎮十七家之一裴玄慶,率領左營高麗都一馬當先殺入其中。而后,又有同樣來自邊地藩部的鋒將弘述，攻殺了匆忙前來支援的周防氏大將，周防兼深。
自此，南原京的城破之局，已然是無力回天了。盡管如此，以西路總大將橘諸良為首的扶桑殘軍，還是竭盡所能以城內街坊為憑據，進行逐街逐巷的負隅頑抗；與不斷涌入城內的行臺軍血戰連天。
僅僅因為，隨軍渡海前來的親眷家族就在子（內）城。而當初為了安置這些遠道而來的家口附庸，他們曾經對于城內原有居民百姓，進行相當殘酷的驅逐和抄家；因此凍斃、餓死、病死荒野無數。
因此，在害怕遭到清算和報復的莫大恐懼驅使之下，就連城內扶桑的老弱婦孺，都主動參與或是協助戰斗。但這也只是拖延了行臺軍控制全城的腳步，卻依舊沒能挽回，城內幾乎是一邊倒的局面。
隨著南原京城來自四面八方，風聞投奔助戰的鄉土士民，不斷的加入進來之后，這些扶桑之民同仇敵愾的拼死抵抗，也只能是回光返照一般的曇花一現。城破后的戰斗持續到第四天，就迎來尾聲。
當扶桑聯軍西路總大將橘諸良，帶領數千傷殘累累的兵卒和兩萬余老弱，在南原京的行宮和子城內，決意以堆滿的柴薪與遍地澆淋的油脂，宣稱要與任何進犯者同歸于盡時，終于有人難以忍受了。
當天夜里，帶甲巡城的橘諸良本人，就被來自舅家親緣的葛城郡司，伊達行朝帶人擊昏于城頭；而橘諸良麾下所剩無幾的扈衛/宮內兵，也被暴起背刺葛城家及其附庸，給殺戮一空又打開了宮門。
由此，短促而激烈的南原京攻防戰落下了帷幕。而在這個過程中江畋就沒再有出手，而繼續扮演了幕后協助的角色。畢竟，靠自己親手收復的國土和建立的功績，才是切切實實的威望和德信所在。
隨著南原京之戰的落幕，西路總大將橘諸良在內，一千六百多名被專門挑選出來；可能具有一定氣數和歷史影響力的存在，被集體血祭在南原京外地理山之后；全州境內的抵抗力量幾乎一掃而空。
當行臺軍再接再厲分兵北上，接連擊破極其微弱的抵抗，收復金馬、金題、任市、大山等十數郡；居然也開始遇到從小股人馬，到成建制投降的扶桑兵；就像他們斗志和勇氣都被埋葬在了南原京。
而當行臺愈發壯大的五路人馬，重新匯聚在了全州與江州交界的臨陂郡時。卻是意外接到了來自江州境內，以官拜金吾少將的有力藩主于良真親為首，來自扶桑東北道七家藩主的交涉條件。
也就是說，在當下形勢之下，他們愿意就此投降行臺，完好無損的交出一切地盤和甲械物資。但是，行臺必須保證他們的人身安全，并且提供足夠的船只和糧秣，令其能夠安然返回扶桑本土。
只是其中也有一條特定的條件，就是作為擔保和見證人，必須是一直被隱藏在行臺幕后，剛剛才在清海鎮顯圣的那位真祖上仙。
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